Сериал 'Сёгун' рассказывает о приключениях американского штурмана Джона Блэкторна, который в 1600 году оказывается в Японии. Его задача - подготовить и модернизировать японскую армию. Джон не новичок в военном деле, он много раз участвовал в боях и знает, как подготовить солдат к экстремальным ситуациям. Однако его противниками становятся самураи - воины, которые придерживаются древних традиций и принципов. Джон понимает, что ему предстоит тяжелая задача, ведь японцы, которых он должен обучать, не готовы к войне. Несмотря на предупреждения, его отряд отправляют в бой, где большинство солдат паникует и бежит. Сам же Джон попадает в плен к самураям, где узнает о их уникальном образе жизни и кодексе чести. Вместе с этим он пытается найти способ справиться со своими противниками и доказать свою ценность в глазах японцев. Столкнувшись с непредсказуемыми ситуациями и сложным выбором между своими принципами и обязанностями, Джон пытается найти свое место в этой древней культуре и завоевать уважение самураев.